Фамилия Жуган имеет восточнославянское происхождение и восходит к прозвищу Жуган, которое, вероятно, связано с глаголом «жечь» или диалектным словом «жуга» (жар, огонь, палящее солнце). Прозвище могло указывать на человека с горячим, вспыльчивым характером или на того, кто занимался выжиганием угля, обжигом глины или другими «огненными» ремеслами. Также возможно происхождение от украинского «жуга» (жар, зной) или белорусского «жуга» (огонь).
Фамилия распространена в Украине, Беларуси и южных регионах России. В исторических документах встречается с XVII века. Суффикс -ан указывает на принадлежность или характерный признак, что типично для украинских и белорусских фамилий. Варианты фамилии: Жуганов, Жуганин, Жугар.
Этимологически родственными являются фамилии с корнем жуг-/жг-, связанные с горением или жаром. Географически фамилия чаще встречается в Черниговской, Киевской и Гомельской областях.
Источники: Унбегаун Б. О. «Русские фамилии»; Никонов В. А. «Словарь русских фамилий»; переписи, избирательные списки и архивные описи.