Фамилия Шикулин имеет русское происхождение и относится к группе фамилий, образованных от прозвищ с суффиксом -ин. Основой послужило прозвище Шикула, которое могло возникнуть от диалектного слова «шикула» (или «шикуля») — в некоторых говорах так называли шишку, нарост, а также неуклюжего, неловкого человека. Возможно также происхождение от глагола «шикать» — шипеть, издавать резкие звуки, что могло характеризовать поведение человека.
Фамилия встречается преимущественно в центральных и северных регионах России, особенно в Вологодской, Архангельской и Кировской областях. Первые упоминания относятся к XV–XVI векам, когда фамилии на -ин активно формировались у крестьян и посадских людей. В некоторых случаях фамилия могла быть образована от имени Шикула как уменьшительной формы от Шика (Шикарь) или от канонического имени Сила (через народную форму Шила).
В современной России фамилия Шикулин не является распространённой, но сохраняется в ряде регионов. Варианты написания: Шикулин, Шикулина (женская форма). Родственные фамилии: Шикулов, Шикуленко, Шикуля.
Источники: Унбегаун Б. О. «Русские фамилии»; Никонов В. А. «Словарь русских фамилий»; переписи, избирательные списки и архивные описи.