Фамилия Протков имеет русское происхождение и относится к группе фамилий, образованных от прозвищ. В основе фамилии лежит прозвище Протко, которое могло возникнуть от глагола 'протыкать' или прилагательного 'проткий' (острый, колкий). Такое прозвище могло характеризовать человека с острым языком или колким характером. Также возможно, что прозвище связано с профессиональной деятельностью, например, с изготовлением или использованием колющих инструментов.
Фамилия Протков встречается в различных регионах России, но не является широко распространённой. В исторических документах фамилия фиксируется с XVII века. Суффикс '-ов' указывает на принадлежность к роду, то есть 'сын Протка'. Варианты фамилии, такие как Протченков, могут быть связаны с диалектными особенностями или патронимическими формами.
Этимологически фамилия Протков не связана с фамилиями, имеющими корень 'корт-' или 'прот-' в значении 'против', а также с фамилиями, образованными от имён типа Протасий. Наиболее близкими родственными фамилиями являются Протченков и, возможно, Протов, но последняя менее вероятна.
Источники: Унбегаун Б. О. «Русские фамилии»; Никонов В. А. «Словарь русских фамилий»; переписи, избирательные списки и архивные описи.