Фамилия Пикун имеет восточнославянское происхождение и образована от прозвища, которое, вероятно, связано с глаголом «пикать» (издавать тонкий звук) или существительным «пик» (острый конец, крик). Прозвище могло указывать на человека с высоким, писклявым голосом или на того, кто часто издавал резкие звуки. Также возможно, что прозвище давалось по характеру или поведению — например, человеку, который «пикал» (жаловался, ныл).
Фамилия распространена в Украине и Беларуси, а также встречается в России. В исторических документах фамилия фиксируется с XVII века. Суффикс -ун характерен для украинских и белорусских фамилий, обозначающих носителя признака (ср. «крикун», «говорун»).
Этимологически фамилия Пикун связана с корнем «пик-», который имеет звукоподражательное происхождение. Родственные фамилии: Пикунов, Пикус, Пикуш, Пискун (с чередованием к/ск).
Источники: Унбегаун Б. О. «Русские фамилии»; Никонов В. А. «Словарь русских фамилий»; переписи, избирательные списки и архивные описи.