Фамилия Миголеня имеет восточнославянское происхождение и относится к группе фамилий, образованных от прозвищ. В основе лежит корень 'миг-', который восходит к глаголу 'мигать' (быстро моргать) или к диалектному слову 'миголь', означающему непоседу, вертлявого человека. Суффикс '-еня' является характерным для белорусских и украинских фамилий, указывая на принадлежность к роду (патронимическое значение). Таким образом, Миголеня — 'потомок Миголи'.
Фамилия распространена преимущественно в Беларуси и на западе Украины, особенно в Гродненской и Волынской областях. Первые упоминания относятся к XVI веку в документах Великого княжества Литовского. Варианты фамилии включают Миголенко, Миголевич, Миголя. Родственные фамилии: Мигун, Мигай, Мигаль.
Этимологически фамилия связана с характеристикой поведения предка — возможно, он был быстрым, подвижным или имел привычку часто моргать. В некоторых говорах 'миголь' также могло означать 'мелькающий', 'непостоянный'.
Источники: Унбегаун Б. О. «Русские фамилии»; Никонов В. А. «Словарь русских фамилий»; переписи, избирательные списки и архивные описи.