Фамилия Худобердинов имеет тюркское происхождение и образована от мужского имени Худоберди (вариант Худаберди), которое в переводе с тюркских языков означает «Бог дал» (худо/худа — «Бог», берди — «дал»). Имя было популярно у народов, исповедующих ислам, и часто давалось в знак благодарности Всевышнему за рождение ребенка. Фамилия образована с помощью русского патронимического суффикса -ов, что характерно для русификации тюркских имен в Российской империи.
Фамилия распространена среди татар, башкир, а также других тюркских народов России и Средней Азии. Встречается в различных регионах, включая Татарстан, Башкортостан, Оренбургскую область и другие. Варианты написания могут включать Худабердинов, Худойбердинов и другие, в зависимости от диалектных особенностей.
Исторически фамилия фиксируется с XIX века, когда у тюркских народов начался процесс массового закрепления фамилий. Первые упоминания относятся к переписям населения и метрическим книгам.
Источники: Унбегаун Б. О. «Русские фамилии»; Никонов В. А. «Словарь русских фамилий»; переписи, избирательные списки и архивные описи.