Фамилия Гижунов имеет русское происхождение и относится к группе фамилий, образованных от прозвищ. В основе лежит прозвище Гижун, которое могло возникнуть от диалектного слова «гиж» (кисть, гроздь) или от глагола «гижать» (кричать, пищать). В некоторых говорах «гижа» означает «грязь, слякоть», что также могло стать источником прозвища. Суффикс -ов указывает на принадлежность: «сын Гижуна».
Фамилия встречается преимущественно в центральных и южных регионах России, а также на Украине. В исторических документах упоминается с XVI века, например, в писцовых книгах Новгородской земли. Варианты написания: Гижунов, Гижуновский, Гижунин.
Этимологически фамилия связана с древнерусскими корнями, обозначающими звукоподражательные или описательные характеристики человека. Родственные фамилии: Гижун, Гижуновский, Гижунин.
Источники: Унбегаун Б. О. «Русские фамилии»; Никонов В. А. «Словарь русских фамилий»; переписи, избирательные списки и архивные описи.