Фамилия Балекеев имеет тюркское происхождение и восходит к личному имени Балекей (варианты: Балакей, Балакай). В тюркских языках 'бала' означает 'ребёнок', 'дитя', а уменьшительно-ласкательный суффикс '-кей' придаёт значение 'малыш', 'дитятко'. Таким образом, Балекей — это ласковое прозвище для младшего ребёнка в семье. Фамилия образована по русской модели с суффиксом '-ев', указывающим на принадлежность ('сын Балекея').
Фамилия распространена среди тюркоязычных народов, особенно у татар и башкир, а также встречается у русских, вероятно, через межэтнические контакты. Встречается в Поволжье, на Урале и в Сибири. Первые упоминания могут относиться к XVI–XVII векам, когда тюркские имена активно входили в русскую антропонимию.
Варианты фамилии: Балекеев, Балекеев, Балакеев. Родственные фамилии: Балеев, Балев, Балекин.
Источники: Унбегаун Б. О. «Русские фамилии»; Никонов В. А. «Словарь русских фамилий»; переписи, избирательные списки и архивные описи.