Фамилия Абу-Бакиров имеет арабское происхождение и образована от мусульманского имени Абу-Бакир (араб. أبو بكر), что означает «отец девственницы» (имеется в виду дочь пророка Мухаммеда Аиша). Имя Абу-Бакир принадлежало первому праведному халифу, сподвижнику пророка. Фамилия распространена среди народов, исповедующих ислам, особенно на Кавказе, в Средней Азии и в татарской среде. Русский суффикс -ов указывает на принадлежность, то есть «сын Абу-Бакира». Встречаются варианты написания: Абубакиров, Абу-Бакиров.
Фамилия фиксируется в документах с XIX века, когда у мусульманских народов Российской империи начали массово появляться фамилии по русскому образцу. Географически чаще всего встречается в Дагестане, Чечне, Татарстане, Башкортостане, а также среди казахов и узбеков. В русском языке двойная фамилия с дефисом сохраняет арабскую конструкцию «Абу-» (отец).
Значение фамилии связано с почитанием первого халифа и подчеркивает религиозную принадлежность носителя к исламу. В современной России фамилия нередко сокращается до Бакиров, что приводит к утрате исходного смысла.
Источники: Унбегаун Б. О. «Русские фамилии»; Никонов В. А. «Словарь русских фамилий»; переписи, избирательные списки и архивные описи.