Фамилия Трушакин имеет русское происхождение и относится к группе фамилий, образованных от прозвищ. В основе лежит прозвище Трушака, которое могло быть связано с глаголом 'трусить' (бояться, робеть) или с диалектным словом 'труха' (мелкий сор, труха). В первом случае прозвище могло указывать на робкий характер человека, во втором — на род занятий (например, тот, кто занимается мусором или отходами). Суффикс '-ин' указывает на принадлежность: 'чей?' — Трушакин, то есть сын или потомок Трушаки.
Фамилия встречается преимущественно в центральных и северных регионах России, а также в Поволжье. В исторических документах фамилия фиксируется с XVI века, например, в писцовых книгах Новгородской земли. Варианты написания: Трушакин, Трушакина (женская форма). Родственные фамилии: Трушин, Трушаков, Трушагин.
Этимологически фамилия связана с древнерусским корнем 'трус-' (трясти, дрожать) или 'трух-' (трухлявый, рассыпчатый). В некоторых говорах 'труша' означает 'мелкий дождь' или 'снежная крупа', что также могло стать источником прозвища.
Источники: Унбегаун Б. О. «Русские фамилии»; Никонов В. А. «Словарь русских фамилий»; переписи, избирательные списки и архивные описи.