Фамилия Комобашкин имеет русское происхождение и относится к группе фамилий, образованных от прозвищ. В основе лежит прозвище Комобашка, которое, вероятно, происходит от диалектного слова «комоб» (ком, кусок, нечто округлое) или от глагола «комкать» (мять, сжимать). Суффикс «-ашк-» является уменьшительно-ласкательным, а окончание «-ин» указывает на принадлежность: «сын Комобашки». Таким образом, фамилия означает «потомок Комобашки».
Фамилия редкая, встречается преимущественно в центральных и северных регионах России. Возможно, прозвище давалось человеку с округлой фигурой или привычкой комкать что-либо. В исторических документах фамилия не зафиксирована, что говорит о её позднем возникновении или локальном распространении.
Этимологически фамилия связана с корнем «ком-» (ком, комок), который присутствует в ряде русских фамилий (Комов, Комков, Комышев). Вариант Комобашкин мог возникнуть в результате диалектных преобразований.
Источники: Унбегаун Б. О. «Русские фамилии»; Никонов В. А. «Словарь русских фамилий»; переписи, избирательные списки и архивные описи.